Klinische Genetik – Humangenetik
Leitung: Dr. med. Katharina Rötzer-Londgin, PhD
Laborverantwortliche: Dr. Julia Richter
Genetische Diagnostik von hereditären Erkrankungen und Tumorprädispositionssyndromen
Wir bieten ein breites Spektrum an molekulargenetischer bzw. molekularzytogenetischer Diagnostik, insbesondere auch im Bereich der seltenen Erkrankungen. Unser Analysenportfolio umfasst unter anderem Entwicklungs- und Wachstumsstörungen, Mikrodeletions- und Mikroduplikationssyndrome, Fiebersyndrome, gastrointestinale Erkrankungen, Hämoglobinopathien und Erythrozytenmembranerkrankungen, angeborene Störungen der Blutbildung, Gerinnungsstörungen, Immundefekte, neurogenetische Erkrankungen wie Epilepsie oder Neuropathien, Bindegewebserkrankungen, Rasopathien sowie erbliche Tumorprädispositionssyndrome. Wir erweitern laufend unser Angebot und etablieren auf Anfrage gerne neue Untersuchungen. Die genetische Beratung rundet unser Angebot ab.
Diagnostische Schwerpunkte
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Mutationsanalysen mittels PCR (Polymerase-Kettenreaktion) und Sanger Sequenzierung oder reverser Hybridisierung sowie Whole Exome Sequencing (WES)
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Nachweis von Gendeletionen bzw. Genduplikationen mittels MLPA (Multiplex Ligation dependent Probe Amplification)
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Nachweis von Methylierungsanomalien mittels MS-PCR (Methylierungs-sensitive PCR) oder MS-MLPA
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Nachweis von Kopienzahlveränderungen und chromosomalen strukturellen Aberrationen mittels Chromosomenanalyse, FISH (Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung) und CGH/SNP Array [komparative genomische Hybridisierung (CGH)/Single-Nucleotid-Polymorphism (SNP)]. Der CGH/SNP Array erlaubt zusätzlich den Nachweis Kopienzahl-neutraler Veränderungen (Loss-of-Heterozygosity, LOH bzw. uniparentale Disomien, UPD)
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Abklärung von Hämoglobinopathien und Thalassämien mittels Hämoglobin-Elektrophorese, HPLC sowie PCR, Sanger Sequenzierung und MLPA
Forschungsschwerpunkte
Der Schwerpunkt unserer Forschung ist die Aufklärung von genetischen Faktoren, die für maligne Erkrankungen (Leukämien) sowie nicht-maligne hämatologische und immunologische Erkrankungen bei Kindern prädisponieren. Die Ergebnisse unserer diagnostischen Arbeit bilden die Basis für weiterführende Forschungsprojekte der St. Anna Kinderkrebsforschung.
Publikationen
- Minkov M†, Zeitlhofer P†, Zoubek A, Kager L, Panzer S, Haas OA. Novel Compound Heterozygous Mutations in Two Families with Bernard-Soulier Syndrome. Front Pediatr 8:589812 (2021). †M.M. and Z.P. contributed equally to this work.
- Karastaneva A, Nebral K, Schlagenhauf A, Baschin M, Juch H, Heitzer E, Speicher M, Hoefler G, Grigorow I, Urban C, Benesch M, Greinacher A, Haas OA, Seidel MG. Novel phenotypes observed in patients with ETV6-linked leukemia/familial thrombocytopenia syndrome and a biallelic ARID5B risk allele as leukemogenic cofactor. J Med Genet. 2020 Jun;57(6):427
- Kager L, Jimenez Heredia R, Hirschmugl T, Dmytrus J, Krolo A, Müller H, Bock C, Zeitlhofer P, Dworzak M, Mann G, Holter W, Haas OA, Boztug K. Targeted mutation screening of 292 candidate genes in 38 children with inborn haematological cytopenias efficiently identifies novel disease-causing mutations. Br J Haematol 182:251 (2018).
- Zeitlhofer P, Kainz M, Kastler L, Niederle B, Haas OA. Genetik des Phäochromozytom/Paragangliom-Tumorspektrums. J Klin Endokrinol Stoffw 10(2):34 (2017)
- Kager L, Bruce LJ, Zeitlhofer P, Flatt JF, Maia TM, Ribeiro ML, Fahrner B, Fritsch G, Boztug K, Haas OA. Band 3 null VIENNA, a novel homozygous SLC4A1 p.Ser477X variant causing severe hemolytic anemia, dyserythropoiesis and complete distal renal tubular acidosis. Pediatr Blood Cancer 64:e26227 (2017).
- Kager L, Minkov M, Zeitlhofer P, Fahrner B, Ratzinger F, Boztug K, Dossenbach-Glaninger A, Haas OA. Two Novel Missense Mutations and a 5bp Deletion in the Erythroid-Specific Promoter of the PKLR Gene in Two Unrelated Patients With Pyruvate Kinase Deficient Transfusion-Dependent Chronic Nonspherocytic Hemolytic Anemia. Pediatr Blood Cancer 63:914 (2016).